El Departamento de Dermatología fue fundado en 1982 por el Dr. Jorge Millán, y funcionaba dando consulta a los pacientes del INCMNSZ que presentaban lesiones cutáneas. En 1984 lo releva el Dr. Luciano Domínguez Soto, quien fungía como interconsultante. Es en 1992 cuando la Dra. Rocío Orozco Topete se hace cargo del Departamento y lo formaliza cuando se autorizó, por parte de la Facultad de Medicina de la UNAM, la impartición del curso de Especialidad de Dermatología.
A partir de entonces cuenta con 7 adscritos y 11 residentes.
La Dra. Judith Domínguez Cherit se integra al Departamento en 1987, en 2009 asume la Coordinación General del Centro Nacional para la Referencia de Enfermedades de las Uñas, pero es hasta el 2011 cuando es designada jefa de Departamento, cargo que deja el 30 de junio del 2024.
A partir del 1º de julio de 2024, la Dra. Linda García Hidalgo asume la jefatura del Departamento.